Discovery Studio 2021(化學(xué)實(shí)驗(yàn)軟件) V2021

　　Discovery Studio2021是一款非常強(qiáng)大的化學(xué)實(shí)驗(yàn)軟件，它的主要功能就是幫助用戶編輯化學(xué)教程時(shí)候，能夠擁有更多的模型和圖紙?jiān)O(shè)計(jì)方案。當(dāng)你需要分析化學(xué)或是分析分子模型的時(shí)候，就能夠通過Discovery Studio 2021將實(shí)驗(yàn)放到軟件上轉(zhuǎn)換為三維分子模型，這樣您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果在軟件上運(yùn)行就更加清晰了。

安裝步驟

　　1、在本站下載解壓文件。

　　2、點(diǎn)擊exe文件。

　　3、選擇安裝路徑。

　　4、點(diǎn)擊安裝。

　　5、安裝中，請(qǐng)稍候。

　　6、安裝完成。

　　7、將破解補(bǔ)丁復(fù)制到安裝路徑。

　　8、破解完成。

軟件功能

　　一、基本界面和顯示模塊

　　1、Discovery Studio Standalone

　　可視化界面，是利用軟件進(jìn)行分子設(shè)計(jì)和模擬的基礎(chǔ)，支持服務(wù)器-客戶端安裝在同一臺(tái)機(jī)器上的運(yùn)行模式。與Pipeline Pilot Server結(jié)合在一起，提供化學(xué)/生物學(xué)數(shù)據(jù)顯示、模擬/分析、構(gòu)建三維分子、展示動(dòng)態(tài)變化、三維作圖及許多其它功能。

　　2、Visualizer Client

　　是服務(wù)器-客戶端運(yùn)行模式中、客戶端的可視化界面，用于訪問和使用服務(wù)器端的軟件。必須與服務(wù)器端配置的Pipeline Pilot Server協(xié)同工作，為用戶提供無與倫比的數(shù)據(jù)、工作流程和計(jì)算資源共享。

　　二、蛋白質(zhì)模擬模塊

　　1、DS MODELER

　　只要給出未知結(jié)構(gòu)序列與另一個(gè)已知三維結(jié)構(gòu)蛋白的比對(duì)，利用工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的快速同源模建方法，便可自動(dòng)并快速產(chǎn)生優(yōu)化的蛋白同源模型。對(duì)于靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及蛋白家族功能結(jié)構(gòu)分析，MODELER是一個(gè)理想的解決方案。用MODELER還可以模擬蛋白突變，進(jìn)行l(wèi)oop區(qū)模建及基于結(jié)構(gòu)的比對(duì)并構(gòu)建有配體結(jié)合的蛋白結(jié)構(gòu)模型。結(jié)合Sequence Analysis模塊，可以全自動(dòng)完成抗體Loop區(qū)模建。結(jié)合軟件里模擬及以結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的藥物設(shè)計(jì)的功能模塊，用MODELER還可以深入研究蛋白結(jié)構(gòu)及功能的關(guān)系。#p#分頁標(biāo)題#e#

　　2、DS Protein Refine

　　利用CHARMm對(duì)模建好的蛋白質(zhì)進(jìn)行側(cè)鏈和loop區(qū)的優(yōu)化，提高蛋白質(zhì)模型的準(zhǔn)確性。

　　3、DS Protein Health

　　蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)合理性評(píng)價(jià)工具。Protein Health模塊運(yùn)用Profiles 3D方法，通過將三維結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)環(huán)境與特定氨基酸殘基的優(yōu)先外界環(huán)境相比較，獲得相關(guān)結(jié)構(gòu)性質(zhì)與氨基酸序列信息之間的關(guān)系。通過Protein Health模塊的分析，用戶可以方便快速地找到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中不合理的區(qū)域。

　　4、DS Protein Families

　　通過分析某一蛋白家族蛋白序列的保守模式以及在三維結(jié)構(gòu)上的保守殘基的位置，可以在分子水平上更好地了解到蛋白功能機(jī)制。Protein Families的簡單易用的流程（protocols），也可一步步地引導(dǎo)用戶進(jìn)行分析，從蛋白家族的序列或者結(jié)構(gòu)比對(duì)，到進(jìn)化蹤跡分析。而進(jìn)化蹤跡分析包括用分層聚類的方法來建立蛋白家族系統(tǒng)樹圖以及把這些得到的功能注釋信息畫到你的三維結(jié)構(gòu)上去。進(jìn)行序列比對(duì)時(shí)，允許根據(jù)需要對(duì)比對(duì)結(jié)果添加約束，提高活性部位關(guān)鍵殘基的比對(duì)效果。

　　5、DS Sequence Analysis

　　與功能已知的其它蛋白的序列進(jìn)行比對(duì)，是確定某一蛋白生物功能的第一步。用Sequence Analysis也可以讓用戶通過通用的BLAST及PSI-BLAST算法來搜索本地?cái)?shù)據(jù)庫或者NCBI網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫，確定蛋白序列的同源區(qū)域。結(jié)果在交互的報(bào)告格式里面顯示以方便進(jìn)行進(jìn)一步的分析及在其它模塊里面的使用。使用Blast搜索PDB或PDB_nr95數(shù)據(jù)庫時(shí)，結(jié)果文件中可以顯示輸出蛋白質(zhì)的SCOP ID， Ligand ID以及X射線分辨率等信息。